Протеомика фокусируется на динамическом описании регуляции генов, количественном определении белковых уровней экспрессии генов, выявлении влияния болезней и препаратов на жизненные процессы, а также объяснении механизма регуляции экспрессии генов. Как наука, протеомические исследования не от нуля Первоначально, это расширение белка (пептид) профиль и ген продукта картографической технологии, которая была использована на протяжении более 20 лет. Пептидное картирование опирается на двухмерный гель-электрофорез (2-DE) и дальнейший анализ изображений; и ген Профиль продукта зависит от различных анализов после разделения, таких как масс-спектрометрия, анализ аминокислотного состава и т.д.
Из-за существования переменного редактирования и редактирования РНК, многие гены могут выражать различные белки. Поэтому сложность протеома намного выше сложности генома.
Если расшифрована вся последовательность генома того или иного вида, это не означает, что также расшифрован протеом этого вида. Специфический анализ белкового продукта гена должен определяться путем всестороннего изменения и регулирования уровня генома, уровня транскрипции и уровня перевода.