По данным на 2013 год, четкая классификация генетически модифицированных продуктов питания не существует, и в соответствии с практикой могут быть сделаны различные классификации в соответствии с различными стандартами.
В зависимости от того, содержит ли генетически модифицированная пища генетически модифицированный источник в качестве стандарта, она может быть разделена на следующие три различных типа:
(1) Генетически модифицированные продукты, которые не содержат генетически модифицированных продуктов относятся к продуктам, которые получены из генетически модифицированных организмов, но сами продукты не содержат каких-либо переданных генов.
(2) Генетически модифицированные продукты содержат генетически модифицированные ингредиенты, но их характеристики были изменены во время обработки, и переданные активные гены больше не существуют в генетически модифицированных продуктах питания.
(3) Генетически модифицированные продукты содержат активные генетические компоненты. После того, как люди едят такие генетически модифицированные организмы или пищу, переданные гены и присущие организмам гены будут влиять на организм человека.